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日本發現新型武漢肺炎變異病毒，與既存的英國、南非與巴西變異病毒株不同，新變異病毒傳染力沒有已知變異病毒強，但可能會降低疫苗免疫效果。新的2019冠狀病毒疾病（COVID-19，武漢肺炎）變異病毒，病毒表面名為E484K的蛋白質發生變異。
截至2月2日為止，日本在機場檢疫發現2例、關東地區發現91例確診感染這種新變異病毒；傳染病研究所認為，新變異病毒是從國外傳入，但無法確認是從哪個國家傳入。
對此，指揮中心發言人莊人祥表示，目前英國、南非與巴西出現的3種變異病毒株，皆有發現病毒表面蛋白質N501Y變異，可能使病毒傳染力變強；日本發現的新變異病毒則僅有E484K變異，沒有發現N501Y變異。「因此，傳染力可能沒有那麼強，但是會降低免疫效果，但是台灣沒有看到相關的病毒變異。」
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