戰勝傳染疾病關鍵大破解:台灣本土研究 「唯快不破」檢測才夠超前部署!

台灣與中國一直以來被認為位在新興傳染病出現的熱區,世界衛生組織於 2018 年底更提出警告,需提防未知疾病(disease X)出現與流行。果不其然,今年的新冠疫情正是從中國爆發。感染症領域專家表示,「知己知彼」才能戰勝病毒,在未來,檢測病原的速度會是掌握疫情的一大關鍵。

疾管署署長周志浩於 2020 年 7 月參加感染症醫學年會分享台灣抗疫經驗,他指出,官民配合、做到超前部署,是台灣防疫成功的關鍵。面對傳染性疾病,快速找出病原,也是「超前部署」的重要環節。

目前,包括美國等多個國家都在使用「 mNGS 病原高通量基因定序的技術」,能快速幫助醫師快速認清楚「敵人是誰」,準確率更盛傳統技術,對於分秒必爭的傳染性疾病來說,尤其可貴。

mNGS檢測新冠病毒,省下的時間有攸關生命

台中榮民總醫院感染科主任劉伯瑜指出,面對新興病原以及未知感染疾病威脅,過去如嚴重急性呼吸道症候群 (SARS) 、伊波拉病毒 (Ebola) 等,光是鑑定病原就得花上半年時間,使防疫難度大增。

「舉SARS為例,當時科學家花了好幾個月的時間,才確認了感染來自一種新型的冠狀病毒,而這幾個月的時間就被耽誤了。」劉伯瑜表示,當時最重要的檢測方式是病毒培養跟一些基本的PCR技術,所以需要比較久的時間跟繁瑣的過程。

而近年來新興的的mNGS原理,就是直接在臨床的檢體中,偵測裡面的非人類DNA的序列,再去做基因定序。之後經過生物資訊比對,找出潛在的感染病原。

「平均來說,這樣的技術可以縮減 2/3 的時間。」劉伯瑜表示,感染性的疾病惡化往往只是一瞬間,省下的每一分鐘,都攸關生命。現階段,中國大陸、美國、英國、德國、法國都已經將這個最新技術應用於新冠病人的檢測。

照片檔 ID:970394890

NGS檢測技術不限於「人」,敗血症、肺炎感染疾病都能用

NGS目前還不是大家所熟悉的名詞,劉伯瑜特別解釋,NGS就是一種基因定序技術,全文是次世代定序技術,這個技術可以用在很多不同的定序上面。「而前面的m指的是metagenomic,就是總體基因定序。也就是說,mNGS是用NGS這個平台,去做總體基因定序這件事情。」

「過去,我們對基因定序的印象,是透過檢測『人』的基因,輔助用藥、篩檢等用途。但是現在,透過 mNGS 技術,可精準地透過定序、比對出『病原』的基因,找出躲在體內的感染病原。」劉伯瑜表示。

總體基因定序可以用的地方非常廣泛,就感染科來講,除了病毒以外,還有細菌、黴菌、寄生蟲,都是mNGS偵測的對象。因此,劉伯瑜指出,不只是新冠病毒,像是引發敗血症、肺炎等的病原,過去的技術可能沒有能力快速找出,但是mNGS就是個新契機。

mNGS比傳統檢測找出超過 2 倍可能病原

近日,台灣首次 mNGS 技術應用於不同檢體 (如:肺泡灌洗液、血液、組織液等)的 臨床結果,於 2020 年感染症醫學年會公布。結果指出,透過 mNGS 技術找到的疑似病原,不但可以涵蓋近 9 成傳統檢測結果,比起傳統檢測,mNGS 找出了超過 2 倍的可能致病微生物。

也就是說,mNGS 病原高通量基因定序可提供臨床醫師更詳細、全面的感染資訊,有機會為患者爭取更多可能。「我們可以期待,新型的檢測方式,能將醫療效率提升至新的高度。」劉伯瑜表示。未來,醫師與病人在面對傳染病時,將會有更多「超前部署」的機會,戰勝疾病。

文/林以璿 圖/林以璿

延伸閱讀:

找出確診者,怎麼反而檢討地方衛生局?台大教授批:台灣怎麼了

《Science》:新冠疫情引發糧食危機!導致肥胖率不減反增

新冠疫情進入新階段!WHO:無症狀年輕人成亞太傳播主力

Heho健康提醒您

若您有任何健康疑慮與問題,請洽詢專業醫療人員。查看疫情最新資訊請至 衛福部疾管署 網站,若有疑似症狀請撥打傳染病諮詢專線 1922。

新冠肺炎 COVID-19 疫苗專區COVID-19 疫苗專區